在2006年之后，刘强东突破3C产品（即计算机、通信和消费类电子产品）的范围，开始做全面服务的线上零售商，经营的产品范围也进一步扩充。此外，随着电子商务的迅速发展，中国的快递服务现状显得非常糟糕。当时，快递速度很慢，商品包装在快递途中被撞击得满是凹痕的现象几乎司空见惯。
对此，刘强东总结道：“来自客户的投诉有70%都是关于快递的，当时什么都很慢……我们意识到，物流与用户的体验有着很大的相关度。”
于是，从2007年开始，京东开始做一些别的电子商务公司没有做的事，那就是从无到有地逐步建设自己的综合物流网络，并承诺从客户下单到收到货物，京东提供全程的物流服务。到2015年，京东在全国的39个城市建造了7个订单履行中心、118个仓库。另外，在全国的500个城市里，设置了1045个小型物流中心。
此外，从2010年开始，京东还提出“211限时达”快递服务，即处于规定服务区域的京东用户，只要在上午11点前提交的现货订单（部分城市为上午10点前，以订单出库后完成拣货时间点开始计算），当日即可收货。如果是在夜间11点前提交的现货订单（以订单出库后完成拣货时间点开始计算），在次日15点前也可以收到货品。此举无疑大大缩短了服务区域内消费者网购的等待时间，并且给消费者带来了更为便捷高效的网购服务体验。如今，京东在物流环节的优势，已经成为京东与竞争对手竞争时重要的“撒手锏”。