如前所述，蒋介石早在4月3日即已拟就了一套“整军、肃党”方案。4月底鲍罗廷回来后，蒋与鲍多次长谈。当蒋逐渐明了鲍的真实态度后，即大胆地向鲍“摊牌”，提出他那套整理党务方案。鲍最初对蒋的方案多持异议。蒋坦言：“对共条件虽苛，然大党允小党在党内活动，无异自取灭亡，能不伤心？惟因总理策略，既在联合各阶级共同奋斗，故余犹不愿违教分裂，忍痛至今也。”鲍始默然。
1926年5月15日，国民党二届二中全会开幕。这实际上是蒋介石执掌国民党最高权力后主持召开的第一次中央全会。当日，蒋介石向大会提出三个议案，分别是《国民党与共产党协定事项》《整理党事案》《选举常务委员会主席案》。第一案由蒋单独提出，后两案与人联名提出。第一案与第二案的内容基本上是蒋介石4月3日建议书中限制共产党活动的内容。据蒋介石日记，当他提出第一案时，“全场相顾惊愕”，他本人也自觉“言之太过，终日不安，精神恍惚异常”，并云“连日心神憧怔，痛苦备尝，至此犹未稍定”。为了使自己过于绷紧的神经有所放松，当天下午由陈其采陪同游白云山。也就是说，蒋介石是怀着极度忐忑不安的心情提出这几个议案的。之所以如此惴惴，即因为提案对两党关系的重大调整，有可能引发难以预料的党际关系的巨大“震荡”。因为事前不知中共方面将作何种反应。在会议开幕之前日，蒋慨叹“余几因此而病神经，党国与本身存亡生死之际，其痛苦盖有如此者”。